蔵の中にひっそりと眠る古い古い碁盤。小学生、進藤ヒカルが盤上に遺された血痕に気付いた時、運命が語り掛ける。――私の声が聞こえるのですか？――声の主は平安の棋聖、藤原佐為。千年の時渡る囲碁ロマン、待望の完全版化！

某天，小學六年級的阿光，在倉庫裡找到古老的棋盤。這一瞬間，寄宿在棋盤的平安時代的天才棋士·藤原佐為，他的靈魂便進入阿光的意識裡。佐為對圍棋執著不變的思念，將阿光漸漸地帶入圍棋的世界……

大切な決意を胸にプロ棋士として新たなスタートを切ったヒカル。佐為直伝の棋風にヒカルの感性が重なる時、囲碁界を揺るがす嵐が巻き起ころうとしていた。プロ棋士編、ここに開幕！！千年の時渡る囲碁ロマン、待望の完全版化！

プロ試験を通過し、棋界に入ったアキラは、“新初段シリーズ”で王座・座間と初対局！！　一方、そのアキラの背を追うヒカルは、“院生試験”という棋界への最初の扉をくぐろうとしていた…！！　千年の時渡る囲碁ロマン、待望の完全版化！